Processos Fonamentals del Material Genètic: ADN
Material Genètic: l'ADN
El material genètic és l'ADN. Un gen és un segment d'ADN que conté informació. El codi genètic és la relació entre la seqüència de les bases dels nucleòtids d'ADN i la seqüència d'aminoàcids de les proteïnes codificades. Llistat de triplets/bases d'ADN i ARN amb el seu significat en aminoàcids. Es dóna en codons d'ARN perquè és l'ARN el que intervé directament en la traducció. Sentit 5'-3'. El triplet ARNt que s'aparella amb el codó ARNm és l'anticodó. Es fa per complementarietat de bases i de forma antiparal·lela: A-T, T-A, C-G.
Replicació de l'ADN
La replicació pot ser:
- Semiconservativa: al final del procés de replicació, cadascun dels ADN resultants està format per un filament original i un de nou.
- Conservativa: un dels ADN és de la cèl·lula mare i l'altre és nou.
- Dispersiva: els ADN fills presentarien segments d'ADN original amb segments nous.
Meselson i Stahl van dur a terme el següent experiment:
- Van cultivar bacteris E. coli en un medi normal.
- Van centrifugar en CsCl.
- Van cultivar E. coli en un medi enriquit de N15.
- Van centrifugar en CsCl.
- Van observar que la densitat de l'ADN amb N normal era menor que la del medi enriquit amb N15.
- Van cultivar bacteris amb N15 en un medi amb N14 i van deixar que es repliquessin un cop.
- Van extreure l'ADN i van centrifugar en CsCl, observant que l'ADN se situava a una alçada intermèdia respecte a les anteriors.
- Van extreure l'ADN de bacteris que havien crescut en medi N15 però que s'havien replicat dos cops en medi N14.
- Van centrifugar i van observar dues bandes, una amb densitat N15 i una altra amb densitat N14.
ADN Polimerasa
Kornberg va aconseguir polimeritzar ADN in vitro. Per a fer-ho va necessitar:
- ADN-nucleòtids trifosfats: T, G, A i C.
- Ions de Mg2+.
- Un encebador per a començar.
- Un patró per a la complementarietat de bases.
Característiques de l'ADN polimerasa:
- És un enzim que conté uns mil aminoàcids.
- Es troba al nucli o als mitocondris.
- Pot unir milers de nucleòtids.
- Té funció exonucleasa.
Les dues cadenes d'ADN es desenrotllen, formant forquetes i una bombolla de replicació.
Replicació en Procariotes
Cairns va estudiar la replicació en procariotes, que tenen un cromosoma circular. Va seguir els següents passos:
- Va cultivar bacteris en un medi amb Timina tritiada (T H3).
- Al cap de 2-3 minuts, va trencar les cèl·lules i va extreure l'ADN per autorradiografia.
- Va observar una bombolla de replicació.
- Va concloure que la replicació parteix d'un punt i s'estén en dues direccions.
Procediment:
- Senyal d'inici: seqüència de bases d'ADN.
- L'helicasa trenca els ponts d'hidrogen entre les dues files d'ADN i les separa. Per a evitar un superenrotllament cal l'acció de la girasa.
- Es forma la forqueta de replicació.
- El procés és bidireccional: l'helicasa actua en un sentit i en el sentit oposat, formant la bombolla.
- La primasa sintetitza fragments curts d'uns 10 nucleòtids que actuen com a encebadors.
- L'ADN polimerasa sintetitza, en sentit 5'-3', una nova fila d'ADN a partir de nucleòtids transferits que aporten l'energia necessària. Aquesta nova fila és la conductora.
- La primasa sintetitza una fila d'uns 40 nucleòtids d'ARN i uns mil nucleòtids d'ADN, formant un fragment d'Okazaki.
- L'exonucleasa treu l'ARN i l'ADN polimerasa omple els buits amb nucleòtids.
- L'enzim ligasa uneix els fragments.
Replicació en Eucariotes
En eucariotes, l'ADN està associat a histones. El procés és més lent, hi ha més bombolles de replicació i els fragments d'Okazaki són més petits. La replicació es dóna en la interfase.
Teoria Gen-Enzim
Garrod va establir un paral·lelisme entre els gens i les substàncies. Crick va proposar la teoria de la col·linearitat, que estableix una correspondència entre la seqüència de nucleòtids del gen i la seqüència d'aminoàcids de l'enzim que el gen codifica. Aquesta teoria inclou els processos de transcripció i traducció.
Transcripció
La transcripció és el pas d'una seqüència de nucleòtids d'ADN a una d'ARN missatger (ARNm). Es necessiten:
- ADN
- Ribonucleòtids trifosfat: A, C, G i U
- ARN polimerasa (ARN-poli) i cofactors
Procariotes
- Inici: abans de la unitat de transcripció hi ha un promotor. Aquest conté una seqüència d'aminoàcids de reconeixement on s'associa l'ARN-poli i el primer nucleòtid que serà transcrit. L'ARN-poli es fixa sobre el promotor, desenrotlla una volta d'hèlix i inicia la polimerització.
- Elongació: l'ARN-poli recorre la cadena d'ADN en sentit 5'-3'.
- Finalització: quan l'ARN-poli arriba a la seqüència terminadora, se separa l'enzim i l'ADN torna a formar la doble hèlix.
- Maduració: l'ARN no madura. En el cas de l'ARNt, s'addiciona el triplet CCA a l'extrem 3'. L'ARNr s'inicia amb l'ARN nuclear.
Eucariotes
- Inici: el promotor fixa l'ARN-poli. Aquest fixa seqüències de consens TATA i CAAT amb proteïnes anomenades factors de transcripció.
- Elongació: en sentit 5'-3', s'afegeixen nucleòtids amb les seves bases nitrogenades complementàries.
- Finalització: en arribar a una seqüència específica, intervé l'enzim poli-A-polimerasa, que afegeix a l'extrem 3' un segment d'uns 200 ribonucleòtids d'adenina (cua poli-A).
- Maduració: l'espliceosoma, un enzim format per ribonucleoproteïnes petites nuclears (RNPpn), separa els introns. Les ARN-ligases específiques empalmen els exons.
Traducció
L'aminoacil-ARNt-sintetasa, juntament amb ATP, forma l'aminoacil-ARNt. La unió de l'aminoàcid i el seu ARNt es dóna entre el grup carboxil (-COOH) i el radical hidroxil (-OH) de l'extrem 3' de l'ARNt. Aquest procés s'anomena activació dels aminoàcids.
Procés:
- Inici: l'ARNm s'uneix a la subunitat ribosòmica petita gràcies a la regió líder. La subunitat es mou fins a trobar el codó d'iniciació, al qual s'associa un aminoacil-ARNt iniciador específic. S'uneix la subunitat ribosòmica gran i es forma el complex actiu. En procariotes, l'ARNm es tradueix abans d'acabar la seva síntesi. En eucariotes, l'ARNm se sintetitza al nucli i ha de passar per un procés de maduració prèvia.
- Elongació: el primer triplet que es tradueix és l'AUG (metionina). El radical -COOH de la metionina s'uneix amb el radical amino de l'aminoàcid següent mitjançant un enllaç peptídic catalitzat per l'enzim peptidil-transferasa. L'ARNt que es troba al centre P marxa i el centre A queda lliure a l'espera d'un nou aminoacil-ARNt. Aquest procés necessita energia en forma de GTP i proteïnes.
- Finalització: la traducció acaba quan apareix un dels codons de terminació: UAA, UAG o UGA. No hi ha cap ARNt amb un anticodó complementari a aquests codons. Són reconeguts pels factors proteics d'alliberament, que s'instal·len sobre el centre A i provoquen que la cadena polipeptídica quedi alliberada.